Starfysh整合了空间转录组学和组织学数据来揭示异质肿瘤免疫中心—小柯机器人—科学网

　　研究小组展示了Starfysh，一个以深度生成模型为主题的计算工具■■★■★★，该模型结合了原型分析和任何已知的细胞类型标记，以表征已知或新的组织特异性细胞状态，而无需单细胞参考★★■。Starfysh用组织学图像改进了复杂组织的空间动力学特征，并使作为跨组织空间枢纽的生态位进行比较。对原发性雌激素受体(ER)阳性乳腺癌★★、三阴性乳腺癌(TNBC)和转移性乳腺癌(MBC)组织的综合分析，确定了具有患者和疾病特异性细胞类型组成的空间枢纽，并揭示了在侵润性MBC中形成免疫抑制中心的代谢重编程。

　　空间分辨基因表达谱提供观察组织配置和细胞间交流的见解。然而★★，基于测序的空间转录组学测序数据作为严格解释细胞状态的参考，大多数不涉及相关的组织学图像■◆■★，也无法推断多个组织的共同邻近区域。